DNR dekoderį USB flash disko formos

• DNR dekoderį USB-flash forma

Jungtinėje Karalystėje, ji sukūrė mažytį automatinį iššifravimas iš pasaulyje genomą. Jis pasirodys lentynose šiemet, ir - su patrauklia kainą. Bendrovė jis bus ne mažiau įdomus DNR analizatorius, kalinys į serverį.

Bendrovė Oxford Nanopore technologijos buvo įvesta miniatiūrinis vienkartinį lemiamą seką bazių DNR molekule - minion.

Visiškai savarankiškas priborchik dydis šiek tiek didesni atminties atmintinės prijungtas prie USB prievado nešiojamas ar kompiuterio. Jame yra visi elementai, reikalingi visiškai genomo sekos: mikropotokovye sistema, unikalius jutiklius ir specializuotus elektronikos.

Iš pradedantysis tikslumas - lygio sekos esamų sistemų, įrenginių kūrėjai teigia.

Prietaisas gamina tiesiogiai skaityti apie "Laiškai" DNR realiu laiku atspindi juos ekrane, taip pat kompiuterių atmintyje įrašus.

Mokslininkai gali nustatyti iš anksto, kiek informacijos jie turi už patirtis, arba genetinio kodo fragmento tikslu jie ieško ir sustabdyti stenograma iš pasiekti rezultatą, greitai pereiti į naują eksperimentą.

Mėginių paruošimas pakalikas sistemos taip pat nereikalauja daug pastangų. Prietaisas veikia su dvigrandę DNR, be to ji nereikalauja išankstinį amplifikacija.

Kai kuriais atvejais jutiklis gali atskirti iš karto molekulė iš kraujo ar serumo mėginio, o kartais gali prireikti nedidelį valomos mechaninio valymo mišinį.

Įdomiau yra tai, kad prietaisas yra pakalikas šalutinis projektas, gimęs sukurti didesni, galingesni daugkartinio naudojimo sistemos sekos - GridION. Abu naudoti tą pačią technologiją iššifruoti genomą, ant kurio biochemikų iš Didžiosios Britanijos ir JAV grupė dirbo apie 20 metų (skaičiuojant nuo pliko idėjos išvaizda). Mechanizmas yra pagrįstas polimerinės membranos su įterptais nano-poras. Šis prietaiso dalis yra gaunamas iš natūralių (baltymų) ir sintetinių molekulių derinys.

Nanopores membranoje yra skirtos perduoti griežtai apibrėžtą molekulę.

Specialiai sukurtas fermentas tirpalas buvo įtraukta į mėginio, ir susitvarko DNR molekulė paeiliui stumia jį per porų yra per verptuvas (žr daugiau, negu).

Šiuo metu, porų yra prijungtas prie elektronine grandinių aptinka elektros virpesius. Pagal savo darbo profilio kiekvieno prietaiso skaičiuoja paskutinį bazinį pora, o su dideliu tikslumu net labai ilgai fragmentų "molekulės gyvenimo".

Baltymų nanopore membrana. Po to, kai jis eina jonų srovę, kuri vyksta "sutrikimų", kuri skiriasi priklausomai nuo tipo, einančios per "Vartai" molekulių. Pagal laipsnį kreipimo dabartinių elektronikos identifikuoja pagrindinius DNR bazių.

Skirtingai nuo savo kolegų mažytė GridION sistemos yra server-dekoderiai komplekso Rūšiuoti (bendrovė ragina savo mazgai - GridION mazgas).

Kiekvienas mazgas turi lizdas, skirtas vienkartinių kasete. Pastaroji turi visą rinkinį reagentų, reikalingų pilną analizę DNR, ir faktinį lustas analizatorių su dviejų tūkstančių nanopores aprašyta aukščiau.

Mazgas GridION mazgas tiksliai išmatuoti jonų sroves viduje mikroschema, dekoduoja juos ir parodo sekos rezultatas. Lygiagrečiai seka genetinis kodas yra įrašytas į išorinį kietąjį diską ar kitą kompiuterio (per USB arba tinklo). Per vieną dieną GridION mazgas gali išduoti dešimtis gigabaitų bazinės sekos duomenų tiriamo DNR.

GridION įrenginys gali būti sukonfigūruotas taip, kad ieškoti ne tik be mėginio ir DNR analizę, bet taip pat kitų molekulių - mokslininkas atitinkamos baltymų arba, pavyzdžiui, sprogiuosius junginius.

Nors "serveris" GridION mazgas gali veikti kaip atskira darbastalio įrangos, ryškiausias rezultatas pasiekiamas, kai keli tokie įtaisai yra sujungti į serverį stovo (standartinis plotis 19 colių) ir akto koncertą, keistis duomenis tiesiogiai dekodavimo metu.

(Beje, matmenimis ir jungtys GridION mazgas atitinka bendro serverio.)

už GridION kasetės.

2013 versija jau 8000, nes iš GridION mazgas nanopore, ir ji turėtų dirbti greičiau nei ankstesnio modelio.

Pasak kūrėjų, 20 šių mašinų serverio stovo galės iššifruoti visą genomą asmens vos 15 minučių.

Abu prietaisai ir GridION (pirmoji versija) ir ryškus Minion, planuojama išleisti į rinką 2012 m. Gamintojas ketina sukurti konkurencingą kainą, lyginant su naujausiomis technologijomis greitųjų dekodavimo genomo.

Visų pirma, "DNR sekos nustatymo - Flash" kainuos mažiau nei $ 900.

"Serveris" GridION mazgas ir iš mazgų serverio stovo rinkinys. Vienas GridION mazgas sunaudoja mažiau nei 50 vatų galios, bendrovė pabrėžia vienas iš prietaiso privalumus.

Čia mes turime prisiminti, kad per metus tiek prieš JAV bendrovė Life Technologies "pristatė stalinį asmeninį genomo iššifravimas Asmeniniai genomo mašina, verta bent $ 100 tūkstančių. Principas primononny jame skiriasi nuo GridION technologijų, bet yra dažni: automatizuotam sekos, mokslininkai taip pat sukūrė mikroschemą, kuri sujungia elektronika su chemija.

2012 sausio mėn Life Technologies "(arba, tiksliau, jos dukterinė bendrovė jonų torrent) parodė savo naują modelį dekoderis genomą vadinamas jonų Protonų. Ši mašina jau yra maždaug $ 149,000, bet mikroschema analizatorius, slepiasi viduje, yra 1000 kartų galingesnis nei praėjusiais atranką.

Aparatai jonų Protonų sugeba perskaityti visą žmogaus genomą į dieną esant "vartojimo" $ 1000 kaina.

Visi šių prietaisų turėtų būti panaikintos, kaip sako mokslininkai, viena iš iš biologijos ir medicinos mokslinių tyrimų skaičius kliūtis - lėtas dekodavimo genomo.

Dabar, ši užduotis gali būti santykinai mažoje laboratorijoje ir iš iššifravimas atveju atmintinės galima teigti, kad DNR iškodavimo technologija yra ant ateina beveik kiekvieną namų slenksčio, kaip cukraus kiekis dabar žmonės nepriklausomai analizuojami kraujo.

iki